Molecular Dynamics Simulation of Nucleic Acids

Artikeleigenschaften
  • Sprache
    English
  • Veröffentlichungsdatum
    2000/10/01
  • Indian UGC (Zeitschrift)
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    200
  • Zitate
    240
  • Thomas E. Cheatham III Department of Medicinal Chemistry, University of Utah, Salt Lake City, Utah 84112-5820;
  • Peter A. Kollman Department of Pharmaceutical Chemistry, University of California, San Francisco, California 94143-0446;
Abstrakt
Zitieren
Cheatham III, Thomas E., and Peter A. Kollman. “Molecular Dynamics Simulation of Nucleic Acids”. Annual Review of Physical Chemistry, vol. 51, no. 1, 2000, pp. 435-71, https://doi.org/10.1146/annurev.physchem.51.1.435.
Cheatham III, T. E., & Kollman, P. A. (2000). Molecular Dynamics Simulation of Nucleic Acids. Annual Review of Physical Chemistry, 51(1), 435-471. https://doi.org/10.1146/annurev.physchem.51.1.435
Cheatham III TE, Kollman PA. Molecular Dynamics Simulation of Nucleic Acids. Annual Review of Physical Chemistry. 2000;51(1):435-71.
Journalkategorien
Science
Chemistry
Science
Chemistry
Physical and theoretical chemistry
Beschreibung

Tauchen Sie ein in die Welt der Nukleinsäuresimulationen und erkunden Sie die Fortschritte und Anwendungen von 1995 bis 2000. Dieser Überblick konzentriert sich auf die Anwendungen und Ergebnisse von Molekulardynamiksimulationen und nicht auf die Methoden selbst. Die Diskussion beginnt mit den jüngsten Fortschritten bei der Simulation von Nukleinsäuren in Lösung und bietet dann eine detaillierte Zusammenfassung der veröffentlichten Literatur, wobei der Schwerpunkt auf Simulationen kleiner Nukleinsäuren in explizitem Lösungsmittel mit Gegenionen liegt. Durch die Verwendung zuverlässiger Kraftfelder und moderner Simulationsprotokolle hebt dieser Überblick die Beobachtung von A-B-Übergängen in Duplex-DNA, die spezifische Ionenbindung und Hydratation sowie die zuverlässige Darstellung von Protein-Nukleinsäure-Wechselwirkungen hervor. Die Autoren untersuchen wichtige Probleme und zukünftige Aussichten und bieten eine wertvolle Ressource für Forscher in der Computerbiologie und verwandten Bereichen. Sie untersuchen Simulationen in Abwesenheit von explizitem Lösungsmittel und stellen fest, dass es keine Simulationen von Protein-Nukleinsäure-Komplexen und modifizierten DNA-Analoga gibt. Diese Arbeit untersucht das zukünftige Versprechen für diese Methoden.

Dieser in der Annual Review of Physical Chemistry erscheinende Überblick ist für Forscher in der physikalischen Chemie und verwandten Bereichen relevant. Er bietet einen umfassenden Überblick über Molekulardynamiksimulationen von Nukleinsäuren, einem wichtigen Forschungsbereich in der biophysikalischen Chemie.

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Zitate
Zitationsanalyse
Die erste Studie, die diesen Artikel zitiert hat, trug den Titel Molecular dynamics simulation of nucleic acids: Successes, limitations, and promise und wurde in 2000. veröffentlicht. Die aktuellste Zitierung stammt aus einer 2023 Studie mit dem Titel Molecular dynamics simulation of nucleic acids: Successes, limitations, and promise Seinen Höhepunkt an Zitierungen erreichte dieser Artikel in 2002 mit 19 Zitierungen.Es wurde in 91 verschiedenen Zeitschriften zitiert., 8% davon sind Open Access. Unter den verwandten Fachzeitschriften wurde diese Forschung am häufigsten von Biophysical Journal zitiert, mit 23 Zitierungen. Die folgende Grafik veranschaulicht die jährlichen Zitationstrends für diesen Artikel.
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